Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CopeO89079 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CopeO89079 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CopeO89079 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CopeO89079 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CopeO89079 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CopeO89079 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CopeO89079 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CopeO89079 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CopeO89079 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopeO89079 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopeO89079 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CopeO89079 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CopeO89079 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CopeO89079 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CopeO89079 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CopeO89079 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CopeO89079 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CopeO89079 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CopeO89079 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CopeO89079 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CopeO89079 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CopeO89079 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CopeO89079 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CopeO89079 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CopeO89079 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CopeO89079 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CopeO89079 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CopeO89079 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CopeO89079 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopeO89079 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopeO89079 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopeO89079 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopeO89079 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopeO89079 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CopeO89079 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CopeO89079 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CopeO89079 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CopeO89079 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CopeO89079 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CopeO89079 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CopeO89079 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CopeO89079 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CopeO89079 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CopeO89079 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CopeO89079 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CopeO89079 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CopeO89079 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CopeO89079 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CopeO89079 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CopeO89079 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CopeO89079 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CopeO89079 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CopeO89079 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CopeO89079 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CopeO89079 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopeO89079 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopeO89079 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopeO89079 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CopeO89079 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopeO89079 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopeO89079 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CopeO89079 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CopeO89079 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CopeO89079 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CopeO89079 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CopeO89079 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CopeO89079 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CopeO89079 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CopeO89079 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CopeO89079 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CopeO89079 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CopeO89079 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CopeO89079 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CopeO89079 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CopeO89079 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CopeO89079 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CopeO89079 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CopeO89079 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CopeO89079 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CopeO89079 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CopeO89079 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CopeO89079 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CopeO89079 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CopeO89079 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CopeO89079 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CopeO89079 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CopeO89079 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CopeO89079 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopeO89079 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopeO89079 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopeO89079 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CopeO89079 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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