Protein–RNA interactions for Protein: O88986

Gcat, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcatO88986 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GcatO88986 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GcatO88986 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GcatO88986 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GcatO88986 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GcatO88986 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GcatO88986 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GcatO88986 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GcatO88986 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GcatO88986 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GcatO88986 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GcatO88986 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GcatO88986 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GcatO88986 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GcatO88986 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GcatO88986 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcatO88986 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcatO88986 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcatO88986 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcatO88986 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GcatO88986 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GcatO88986 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GcatO88986 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GcatO88986 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GcatO88986 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GcatO88986 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GcatO88986 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GcatO88986 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GcatO88986 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GcatO88986 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GcatO88986 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GcatO88986 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GcatO88986 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GcatO88986 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GcatO88986 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GcatO88986 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GcatO88986 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GcatO88986 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GcatO88986 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GcatO88986 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GcatO88986 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GcatO88986 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GcatO88986 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcatO88986 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcatO88986 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcatO88986 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GcatO88986 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GcatO88986 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GcatO88986 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GcatO88986 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GcatO88986 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GcatO88986 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GcatO88986 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GcatO88986 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GcatO88986 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcatO88986 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcatO88986 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcatO88986 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GcatO88986 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GcatO88986 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GcatO88986 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GcatO88986 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GcatO88986 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GcatO88986 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcatO88986 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GcatO88986 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GcatO88986 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GcatO88986 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GcatO88986 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GcatO88986 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GcatO88986 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GcatO88986 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GcatO88986 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GcatO88986 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GcatO88986 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GcatO88986 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GcatO88986 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GcatO88986 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcatO88986 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcatO88986 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GcatO88986 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GcatO88986 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GcatO88986 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcatO88986 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcatO88986 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcatO88986 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GcatO88986 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcatO88986 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcatO88986 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GcatO88986 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GcatO88986 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GcatO88986 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GcatO88986 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GcatO88986 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GcatO88986 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GcatO88986 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GcatO88986 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GcatO88986 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GcatO88986 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GcatO88986 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms