Protein–RNA interactions for Protein: O88502

Pde8a, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8aO88502 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pde8aO88502 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pde8aO88502 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pde8aO88502 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pde8aO88502 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pde8aO88502 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pde8aO88502 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.6 ms