Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dync1i1O88485 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dync1i1O88485 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dync1i1O88485 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dync1i1O88485 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dync1i1O88485 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dync1i1O88485 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dync1i1O88485 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dync1i1O88485 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms