Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klc1O88447 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Klc1O88447 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klc1O88447 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klc1O88447 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klc1O88447 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klc1O88447 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Klc1O88447 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc1O88447 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klc1O88447 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Klc1O88447 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klc1O88447 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms