Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grpel2O88396 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grpel2O88396 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Grpel2O88396 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Grpel2O88396 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms