Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnnt1O88346 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnnt1O88346 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tnnt1O88346 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tnnt1O88346 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnnt1O88346 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tnnt1O88346 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tnnt1O88346 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.41
Tnnt1O88346 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt1O88346 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tnnt1O88346 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnnt1O88346 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnnt1O88346 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms