Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pknox1O70477 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pknox1O70477 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pknox1O70477 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pknox1O70477 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pknox1O70477 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pknox1O70477 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms