Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hmx1O70218 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hmx1O70218 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hmx1O70218 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hmx1O70218 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmx1O70218 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmx1O70218 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms