Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HcrtO55241 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HcrtO55241 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HcrtO55241 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HcrtO55241 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HcrtO55241 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HcrtO55241 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HcrtO55241 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HcrtO55241 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HcrtO55241 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HcrtO55241 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HcrtO55241 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HcrtO55241 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HcrtO55241 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HcrtO55241 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HcrtO55241 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HcrtO55241 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HcrtO55241 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HcrtO55241 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HcrtO55241 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HcrtO55241 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HcrtO55241 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HcrtO55241 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms