Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cbx4O55187 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cbx4O55187 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cbx4O55187 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx4O55187 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx4O55187 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cbx4O55187 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx4O55187 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx4O55187 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx4O55187 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx4O55187 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx4O55187 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx4O55187 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms