Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg2O55111 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg2O55111 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg2O55111 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dsg2O55111 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dsg2O55111 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms