Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Bnip3O55003 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bnip3O55003 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Bnip3O55003 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bnip3O55003 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Bnip3O55003 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bnip3O55003 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bnip3O55003 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bnip3O55003 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Bnip3O55003 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bnip3O55003 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bnip3O55003 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bnip3O55003 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Bnip3O55003 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bnip3O55003 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Bnip3O55003 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Bnip3O55003 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Bnip3O55003 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Bnip3O55003 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Bnip3O55003 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms