Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Csnk2a2O54833 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Csnk2a2O54833 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csnk2a2O54833 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csnk2a2O54833 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csnk2a2O54833 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csnk2a2O54833 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms