Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pik3cdO35904 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pik3cdO35904 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pik3cdO35904 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pik3cdO35904 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pik3cdO35904 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pik3cdO35904 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pik3cdO35904 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms