Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfrsf18O35714 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnfrsf18O35714 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfrsf18O35714 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnfrsf18O35714 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfrsf18O35714 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tnfrsf18O35714 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tnfrsf18O35714 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfrsf18O35714 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfrsf18O35714 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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