Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scamp3O35609 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scamp3O35609 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scamp3O35609 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Scamp3O35609 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scamp3O35609 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scamp3O35609 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms