Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stx1aO35526 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stx1aO35526 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stx1aO35526 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stx1aO35526 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Stx1aO35526 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx1aO35526 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms