Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Slc27a2O35488 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc27a2O35488 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc27a2O35488 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc27a2O35488 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc27a2O35488 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms