Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1dO35473 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C1dO35473 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1dO35473 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C1dO35473 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1dO35473 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C1dO35473 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C1dO35473 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1dO35473 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1dO35473 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1dO35473 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1dO35473 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1dO35473 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C1dO35473 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1dO35473 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
C1dO35473 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C1dO35473 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1dO35473 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1dO35473 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1dO35473 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1dO35473 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1dO35473 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1dO35473 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1dO35473 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1dO35473 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1dO35473 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1dO35473 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
C1dO35473 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1dO35473 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1dO35473 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1dO35473 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1dO35473 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1dO35473 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1dO35473 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1dO35473 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1dO35473 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1dO35473 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1dO35473 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1dO35473 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1dO35473 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C1dO35473 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1dO35473 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C1dO35473 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1dO35473 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1dO35473 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1dO35473 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C1dO35473 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1dO35473 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1dO35473 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C1dO35473 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C1dO35473 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1dO35473 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1dO35473 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1dO35473 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C1dO35473 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1dO35473 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C1dO35473 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C1dO35473 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1dO35473 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C1dO35473 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1dO35473 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C1dO35473 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1dO35473 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1dO35473 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C1dO35473 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C1dO35473 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1dO35473 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1dO35473 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1dO35473 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1dO35473 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1dO35473 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C1dO35473 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1dO35473 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1dO35473 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1dO35473 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1dO35473 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1dO35473 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C1dO35473 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1dO35473 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1dO35473 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C1dO35473 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1dO35473 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1dO35473 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1dO35473 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1dO35473 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1dO35473 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1dO35473 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C1dO35473 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1dO35473 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1dO35473 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C1dO35473 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1dO35473 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1dO35473 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C1dO35473 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1dO35473 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1dO35473 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1dO35473 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1dO35473 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1dO35473 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1dO35473 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234 ms