Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NumblO08919 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NumblO08919 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NumblO08919 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NumblO08919 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NumblO08919 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NumblO08919 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NumblO08919 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NumblO08919 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NumblO08919 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NumblO08919 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NumblO08919 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NumblO08919 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NumblO08919 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NumblO08919 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NumblO08919 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NumblO08919 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NumblO08919 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NumblO08919 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NumblO08919 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NumblO08919 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NumblO08919 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NumblO08919 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NumblO08919 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NumblO08919 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NumblO08919 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NumblO08919 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NumblO08919 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NumblO08919 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NumblO08919 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NumblO08919 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NumblO08919 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NumblO08919 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NumblO08919 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NumblO08919 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NumblO08919 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NumblO08919 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NumblO08919 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NumblO08919 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NumblO08919 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NumblO08919 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NumblO08919 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NumblO08919 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NumblO08919 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NumblO08919 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NumblO08919 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NumblO08919 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NumblO08919 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NumblO08919 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NumblO08919 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NumblO08919 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NumblO08919 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NumblO08919 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NumblO08919 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NumblO08919 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NumblO08919 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NumblO08919 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NumblO08919 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NumblO08919 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NumblO08919 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NumblO08919 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NumblO08919 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NumblO08919 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NumblO08919 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NumblO08919 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NumblO08919 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NumblO08919 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NumblO08919 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NumblO08919 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NumblO08919 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NumblO08919 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NumblO08919 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NumblO08919 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NumblO08919 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NumblO08919 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NumblO08919 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NumblO08919 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NumblO08919 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NumblO08919 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NumblO08919 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NumblO08919 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NumblO08919 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NumblO08919 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NumblO08919 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NumblO08919 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NumblO08919 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NumblO08919 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NumblO08919 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NumblO08919 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NumblO08919 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NumblO08919 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NumblO08919 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NumblO08919 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms