Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EllO08856 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EllO08856 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EllO08856 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EllO08856 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EllO08856 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EllO08856 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EllO08856 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EllO08856 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EllO08856 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EllO08856 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EllO08856 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EllO08856 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EllO08856 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EllO08856 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EllO08856 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EllO08856 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EllO08856 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EllO08856 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EllO08856 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EllO08856 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EllO08856 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EllO08856 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EllO08856 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EllO08856 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EllO08856 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EllO08856 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EllO08856 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EllO08856 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EllO08856 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EllO08856 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EllO08856 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EllO08856 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EllO08856 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EllO08856 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EllO08856 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EllO08856 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EllO08856 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EllO08856 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EllO08856 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EllO08856 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EllO08856 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EllO08856 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EllO08856 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EllO08856 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EllO08856 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EllO08856 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EllO08856 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EllO08856 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EllO08856 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EllO08856 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EllO08856 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EllO08856 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EllO08856 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EllO08856 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EllO08856 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EllO08856 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EllO08856 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EllO08856 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EllO08856 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EllO08856 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EllO08856 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EllO08856 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EllO08856 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EllO08856 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EllO08856 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EllO08856 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EllO08856 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EllO08856 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EllO08856 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EllO08856 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EllO08856 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EllO08856 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EllO08856 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EllO08856 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EllO08856 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EllO08856 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EllO08856 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EllO08856 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EllO08856 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EllO08856 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EllO08856 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EllO08856 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EllO08856 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EllO08856 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EllO08856 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EllO08856 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EllO08856 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EllO08856 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EllO08856 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EllO08856 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EllO08856 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EllO08856 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EllO08856 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EllO08856 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EllO08856 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EllO08856 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EllO08856 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EllO08856 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EllO08856 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms