Protein–RNA interactions for Protein: O08740

Polr2j, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2jO08740 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr2jO08740 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2jO08740 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2jO08740 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2jO08740 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2jO08740 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms