Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sec22bO08547 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sec22bO08547 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sec22bO08547 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sec22bO08547 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sec22bO08547 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms