Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Usp35M0QWN7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp35M0QWN7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp35M0QWN7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp35M0QWN7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Usp35M0QWN7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Usp35M0QWN7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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