Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Zfp955bL7N232 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zfp955bL7N232 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp955bL7N232 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Zfp955bL7N232 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zfp955bL7N232 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms