Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21976J3QNN2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21976J3QNN2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21976J3QNN2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21976J3QNN2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21976J3QNN2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21976J3QNN2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21976J3QNN2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21976J3QNN2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21976J3QNN2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21976J3QNN2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21976J3QNN2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21976J3QNN2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21976J3QNN2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
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