Protein–RNA interactions for Protein: J3QMB3

Fam240b, Family with sequence similarity 240 member B, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240bJ3QMB3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam240bJ3QMB3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam240bJ3QMB3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam240bJ3QMB3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam240bJ3QMB3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam240bJ3QMB3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms