Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem200cJ3QK46 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem200cJ3QK46 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem200cJ3QK46 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmem200cJ3QK46 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmem200cJ3QK46 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tmem200cJ3QK46 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms