Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm21060J3KMU4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21060J3KMU4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21060J3KMU4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21060J3KMU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm21060J3KMU4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms