Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpc4lG5E8X2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc4lG5E8X2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pabpc4lG5E8X2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pabpc4lG5E8X2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pabpc4lG5E8X2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pabpc4lG5E8X2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pabpc4lG5E8X2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms