Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
4933406M09RikG3XA12 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
4933406M09RikG3XA12 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
4933406M09RikG3XA12 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4933406M09RikG3XA12 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
4933406M09RikG3XA12 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4933406M09RikG3XA12 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms