Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sh3tc1G3X9F6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sh3tc1G3X9F6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sh3tc1G3X9F6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sh3tc1G3X9F6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sh3tc1G3X9F6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sh3tc1G3X9F6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sh3tc1G3X9F6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms