Protein–RNA interactions for Protein: G3UW59

Ubap1l, MCG16443, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1lG3UW59 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Ubap1lG3UW59 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ubap1lG3UW59 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ubap1lG3UW59 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ubap1lG3UW59 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
Ubap1lG3UW59 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ubap1lG3UW59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Ubap1lG3UW59 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Ubap1lG3UW59 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Ubap1lG3UW59 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Ubap1lG3UW59 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ubap1lG3UW59 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ubap1lG3UW59 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ubap1lG3UW59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ubap1lG3UW59 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ubap1lG3UW59 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ubap1lG3UW59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms