Protein–RNA interactions for Protein: F8VQG7

N4bp2, NEDD4-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp2F8VQG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
N4bp2F8VQG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
N4bp2F8VQG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
N4bp2F8VQG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
N4bp2F8VQG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
N4bp2F8VQG7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
N4bp2F8VQG7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
N4bp2F8VQG7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
N4bp2F8VQG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
N4bp2F8VQG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
N4bp2F8VQG7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
N4bp2F8VQG7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
N4bp2F8VQG7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
N4bp2F8VQG7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms