Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm5160F8VPN3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm5160F8VPN3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm5160F8VPN3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm5160F8VPN3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm5160F8VPN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm5160F8VPN3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm5160F8VPN3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm5160F8VPN3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm5160F8VPN3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms