Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ttc37F8VPK0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ttc37F8VPK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Ttc37F8VPK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ttc37F8VPK0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ttc37F8VPK0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ttc37F8VPK0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Ttc37F8VPK0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Ttc37F8VPK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ttc37F8VPK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Ttc37F8VPK0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Ttc37F8VPK0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Ttc37F8VPK0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ttc37F8VPK0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ttc37F8VPK0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ttc37F8VPK0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
Ttc37F8VPK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ttc37F8VPK0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ttc37F8VPK0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ttc37F8VPK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Ttc37F8VPK0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ttc37F8VPK0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ttc37F8VPK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ttc37F8VPK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Ttc37F8VPK0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms