Protein–RNA interactions for Protein: F7D3W5

Gm45837, Phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45837F7D3W5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm45837F7D3W5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm45837F7D3W5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm45837F7D3W5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm45837F7D3W5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm45837F7D3W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm45837F7D3W5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm45837F7D3W5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm45837F7D3W5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm45837F7D3W5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm45837F7D3W5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms