Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3371F7CQW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3371F7CQW8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3371F7CQW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3371F7CQW8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm3371F7CQW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3371F7CQW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3371F7CQW8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3371F7CQW8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm3371F7CQW8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3371F7CQW8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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