Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm5798F7BTS7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5798F7BTS7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5798F7BTS7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5798F7BTS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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