Protein–RNA interactions for Protein: F6Z0L5

Gm17402, Predicted gene, 17402, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17402F6Z0L5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm17402F6Z0L5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm17402F6Z0L5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm17402F6Z0L5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17402F6Z0L5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17402F6Z0L5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17402F6Z0L5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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