Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm17093F6XGJ4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm17093F6XGJ4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm17093F6XGJ4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm17093F6XGJ4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm17093F6XGJ4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms