Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp946F6VWU8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp946F6VWU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp946F6VWU8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zfp946F6VWU8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zfp946F6VWU8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms