Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Syngap1F6SEU4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Syngap1F6SEU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syngap1F6SEU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syngap1F6SEU4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Syngap1F6SEU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Syngap1F6SEU4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms