Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Raph1F2Z3U3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Raph1F2Z3U3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Raph1F2Z3U3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Raph1F2Z3U3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Raph1F2Z3U3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.3 ms