Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh18E9Q9Q6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh18E9Q9Q6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh18E9Q9Q6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh18E9Q9Q6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh18E9Q9Q6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdh18E9Q9Q6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh18E9Q9Q6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cdh18E9Q9Q6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms