Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700024B05RikE9Q6D7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700024B05RikE9Q6D7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
1700024B05RikE9Q6D7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
1700024B05RikE9Q6D7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
1700024B05RikE9Q6D7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms