Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtproE9Q612 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PtproE9Q612 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtproE9Q612 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PtproE9Q612 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PtproE9Q612 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtproE9Q612 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms