Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
8030474K03RikE9Q4Y8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms