Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ApobE9Q414 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ApobE9Q414 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ApobE9Q414 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ApobE9Q414 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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